含有害離子肥料：氯化銨、氯化鉀化肥，含有大量有害的氯離子，施入土壤后產(chǎn)生水溶性化合物，會燒種燒苗；硝酸銨、硝酸鉀等肥料，含有硝酸根離子，對種子發(fā)芽有嚴重影響，故不宜用作種肥。

含有毒害作用的肥料：尿素中含有2%左右的縮二尿，對種子和幼苗會產(chǎn)生毒害作用。而且含氮量高的尿素分子也會滲入種子蛋白質(zhì)分子結構中使蛋白質(zhì)變性，對種子和幼根產(chǎn)生毒害。

含有揮發(fā)腐蝕性的肥料：碳銨、氨水等，有強烈的揮發(fā)性，易熏傷種子和幼苗。普鈣含有5%以上的游離態(tài)硫酸和磷酸，對種子發(fā)芽和幼苗生長會產(chǎn)生危害，一般不宜作種肥。